Joji Hattori erfreut sich einer breitgefächerten Karriere als Musiker, erst als Konzertgeiger, eine Tätigkeit, die sich in die Leitung von Kammerorchestern und später das Dirigieren von symphonischen Orchestern und Opern entwickelte. Seit 2004 ist er Associate Conductor des Wiener KammerOrchesters und wurde im August 2007 zum zum ersten Kapellmeister der Oper Erfurt ernannt.
Im Juni 2009 feierte er sein Debut mit "Die Zauberflöte" an der Wiener Staatsoper.
Zusätzlich zu seiner Konzerttätigkeit unterrichtet Joji Hattori als Gastprofessor an der Royal Academy in London, wo er 2003 zum Honorary Member ernannt wurde. Des weiteren studierte er Soziologie am St. Antony College der Universität Oxford. Seit 2002 ist Joji Hattori Vorsitzender und Künstlerischer Leiter des Yehudi Menuhin Violin-Wettbewerbs.


Von April bis Juli 2012 findet die jährliche Japan-Tournee der Wiener Sängerknaben statt.